Окуловский район и все водоемы, расположенные на его территории, относятся к бассейну Балтийского моря. Главной водной артерией является река Мста, которая является второй по величине в области. Для нее характерен высокий подъем воды в весеннее половодье, а затем медленный спад ее уровней, который может достигать 1,5-2 месяца. Глубина реки сильно колеблется от 3-5 метров на плесах до 0,2-0,4 метров на порогах. Ширина ее в среднем составляет 60-70 метров. Все остальные реки являются притоками Мсты различного порядка. Они относятся к малым, так как длина их не превышает 100 км. Наиболее значительные из них: Перетна, Щегринка, Льняная. Водный режим их достаточно однообразен. Они имеют значительные уклоны и быстрое течение, высокое и быстротечное половодье с преимущественно весенним стоком. В летнюю пору расходы воды в реках сильно уменьшаются.
На территории района находится 64 озера. Некоторые озера путем строительства гидротехнических сооружений превращаются в водохранилища.
Крупных болот на территории района относительно немного.
Наблюдения за содержанием вредных веществ по гидрохимическим показателям ведется в районе на реке Перетна. Они неоспоримо доказывают негативное влияние города Окуловка на качество воды в данном водостоке.
Анализ ее проб показывает, что ниже по течению от районного центра река перетна содержит гораздо больше тяжелых металлов (цинк, хром, медь), фосфатов и других вредных веществ, чем выше.
Водопользование: всего на территории района 22 водопользователя. Их водохозяйственная деятельность характеризуется в основном сбросом сырой воды из поверхностных источников и подземных горизонтов, сбросом сточных вод в открытые водоемы и на рельеф местности или в накопители, массой отведения загрязняющих веществ в водные и другие объекты.
Недостаточно очищенные сточные воды занимают в общем 40-45%.
Учитывая, что основная часть из них поступила в небольшие реки, обладающие малой ассимилирующей способностью, экологический ущерб им наносится в значительных размерах.
В целом следует отметить, что водо-охранная работа в районе находится на крайне низком уровне и является одной из самых худших в области.